Menú Javascript Incompatible con Galería de Imágenes Php

Phpero
19 de Septiembre del 2004
He colocado un menú (en javascript) mediante el cual poder navegar por diferentes galerías de imágenes (hechas en php).
Para ello inserté el código javascript del menú en el body, y las galerías de imágenes las agregué mediante un <? include ("galeria.php"); ?>
El problema es que se ve la galería de imágenes, pero no el menú. Sé que el problema es que el javascript trabaja en el lado del cliente, y el php en el lado del servidor. ¿Hay alguna manera de compatibilizarlo y que todo funcione?
Gracias.