Se me agota el tiempo en el servidor

Adri
14 de Enero del 2004
Hola:
Estoy usando php, mysql y apache en una maquina con linux.
El problema es que hago una consulta donde, ingresando una fecha de inicio en un campo de texto y otra fecha de fin en otro campo de texto, me devuelve todos los registros que encuentra con ese periodo.
Cuando el periodo de tiempo es corto (de no mas de tres meses) no hay mayor problema, pero cuando el periodo de tiempo es mayor a tres meses se me agota el tiempo en el servidor.
Hay veces que la maquina esta un poco mas lenta, entonces el tiempo en el servidor se me agota aunque las dos fechas sean iguales.
¿Me pueden decir cual puede ser el problema?
El codigo no es porque en una maquina con windows, no tengo ningun problema.
Desde ya muchas gracias por su ayuda.